La lotteria Eurojackpot è stata proposta per la prima volta nel 2006, in seguito alle considerevoli offerte di jackpot dell'epoca, in particolare da Lotteria EuroMillions. Un accordo per il lancio di questa lotteria multinazionale è stato raggiunto nel 2011 a Helsinki.
A seguito dell'accordo, sette paesi, Danimarca, Finlandia, Germania, Slovenia, Italia e Paesi Bassi, hanno partecipato alla prima estrazione dell'Eurojackpot il 23 marzo 2012. Poco dopo, un giocatore tedesco ha vinto 19,5 milioni di euro, il che ha acceso l'interesse per il lotteria al di fuori del paesi partecipanti.
Altri paesi si sono affrettati ad aderire, tra cui Spagna, Norvegia, Svezia, Croazia, Lituania, Lettonia, Islanda, Repubblica Ceca e Ungheria. L'accettazione di Eurojackpot nella maggior parte dei paesi europei ha permesso di assicurarsi un vasto pubblico.
Il 3 maggio 2013, un giocatore norvegese, Yngvar Borgerson, ha vinto il jackpot. Questo ha segnato la prima di numerose vittorie storiche distribuite in pochi mesi. Ha anche portato a nuovi sviluppi che hanno visto il cambio di formato il 10 ottobre 2014.
Tuttavia, questo nuovo formato non ha impedito ai giocatori di tentare la grande vittoria. Le vincite delle lotterie jackpot di € 31,5, € 84,8, € 90 e € 90 milioni sono state registrate in ottobre 2015, luglio 2016, ottobre 2016 e gennaio 2017. L'importo di € 90 milioni è stato vinto da cinque diversi giocatori dalla Germania (3 giocatori) , Danimarca e Paesi Bassi.
Nel corso degli anni, altri paesi europei hanno aderito e, a dicembre 2020, il numero di paesi è pari a 18.